第五季结尾，艾莉森·迪劳伦蒂斯回到玫瑰镇，斯宾塞、汉娜、艾米丽和阿里亚终于得知了“A”的真实身份——查尔斯·迪劳伦蒂斯，艾莉森的双胞胎兄弟。然而，查尔斯被逮捕后，看似平静的校园生活并未持续太久。第六季开篇，五位女孩试图摆脱过去的阴影，但一封神秘的新短信打破了她们的努力：“你们以为结束了？一切才刚刚开始。”

新A比查尔斯更善于操控人心，不仅掌握她们最私密的秘密，还精准地攻击她们各自的软肋。斯宾塞面临家庭危机与学业压力，汉娜的婚礼计划被恶意搅乱，艾米丽的感情生活遭到窥探，阿里亚的写作灵感被扭曲利用，而艾莉森则发现自己始终被家族的历史纠缠。她们被迫重新聚集，在废弃的教堂、阴森的树林和迪劳伦蒂斯庄园的密室中寻找线索。

随着调查深入，女孩们发现新A与玫瑰镇一个被掩盖了二十年的旧案有关，而所有线索都指向一个意想不到的人。与此同时，艾莉森的身世之谜再度浮出水面，她与双胞胎兄弟的关系远比想象中复杂。当真相逐渐清晰，她们意识到，新A的目标不只是折磨她们，而是彻底摧毁她们之间的友谊与信任。最终对决中，女孩们设下陷阱，却意外揭开了一个足以改变所有人命运的惊天秘密，为第七季的终极谜局埋下伏笔。