影片《这不是误会》围绕一封匿名检举信展开。清晨，纪律检查干部姜钟琪来到哥哥姜维平管理的菜市场，调查两封内容相悖的举报信：一封指控水产组营业员李晓青利用职务之便收取顾客华侨券，另一封则署名李晓青，反向检举水产组存在集体舞弊。姜钟琪深知此类案件往往牵连人际网络与历史积怨，遂决定从细微线索入手。

调查过程中，李晓青的沉默与同事们的闪烁其词令案件扑朔迷离。姜钟琪发现，华侨券事件背后实为一场因误会引发的连锁反应——李晓青曾为帮助一位困难顾客而私下兑换票券，却被有心人曲解为贪腐。与此同时，哥哥姜维平因担心影响市场声誉，多次暗示妹妹“大事化小”，而李晓青的委屈与倔强也让姜钟琪陷入情与法的挣扎。

通过反复走访和证据比对，姜钟琪最终还原真相：所谓“检举”实为个别员工因嫉妒与误解而错写，而李晓青的主动举报则是为了自证清白。影片以平实镜头语言展现基层纪检干部在人情社会中的坚守，强调“不冤枉一个好人，也不放过一个错误”的执纪理念。误会虽解，但留下的思考却发人深省——信任的建立往往比真相的揭露更为艰难。