《黑之契约者》设定在近未来东京，被称为“地狱门”的异空间突然出现，随之而来的是一群拥有超能力的“契约者”。他们每次使用力量都需支付相应代价，从记忆、情感到身体机能不等，因此多数契约者冷酷无情，被视为危险存在。故事主角李舜生，化名“黑”，表面是普通中国留学生，实则隶属于神秘组织，代号BK201，负责执行针对契约者及其他势力的暗杀与回收任务。

黑的搭档是活泼少女银，以及伪装成大叔的猫型契约者。三人小队在一次次任务中，逐渐卷入围绕“地狱门”和“契约者起源”的巨大阴谋。黑拥有罕见的双重身份——他既是契约者，又保留着人类情感，这使他成为各方势力争夺的关键。随着调查深入，黑发现自己的妹妹“白”与地狱门真相密切相关，而昔日同伴也因契约代价逐渐异化。

故事以单元剧与主线交织推进，每集展现不同契约者的命运与代价，同时暗线逐步揭示“地狱门”的真相、契约者的未来以及人类与超能力者共存的可能。黑在冷酷任务中不断寻找自我，面对友情、爱情与背叛的抉择，最终必须直面“契约者是否仍能称之为人”的终极命题。全作融合科幻、动作与悬疑元素，以灰暗都市为舞台，探讨理性与情感、代价与救赎的深刻主题。